۳-۳-روش انجام طرح………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۳۸
۳-۳-۱-مواد وتجهیزات……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۳۸
عنوان صفحه
۳-۳-۱-۱-دستگاه ها و وسایل مورد نیاز…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۳۸
۳-۳-۱-۲-مواد مصرفی مورد نیاز………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۴۱
۳-۳-۱-۳-محیط های کشت مورد استفاده………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۴۱
۳-۴-ترکیبات و محلول های مورد استفاده در تحقیق و فرمول ساخت آنها……………………………………………………………………………………………..۴۱
۳-۵-روش اجرا…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۴۳
۳-۵-۱-جمع آوری اطلاعات………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۴۳
۳-۵-۲-انجام امور باکتریولوژیک……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۴۳
۳-۵-۳-نمونه برداری، کشت، جداسازی و تعیین هویت باکتری ها……………………………………………………………………………………………………………۴۳
۳-۵-۳-۱-نمونه برداری………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۴۳
۳-۵-۳-۲-طرز تهییه محیط های کشت………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۴۳
۳-۵-۳-۳-نگه داری نمونه های عفونت ادراری………………………………………………………………………………………………………………………………………………۴۵
۳-۵-۳-۴-نگه داری سویه باکتری………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۴۵
۳-۵-۴-استخراج، تعیین کمیت و کیفیت DNA……………………………………………………………………………………………………………………………………………….46
۳-۵-۴-۱-استخراج DNA……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..46
۳-۵-۴-۲-کمیت سنجی و غلظت سنجی DNA استخراج شده…………………………………………………………………………………………………………………..۴۶
۳-۵-۵-انجام آزمایشات مولکولی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۴۷
۳-۵-۵-۱-پرایمرها……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۴۷
۳-۵-۵-۲-رقیق سازی پرایمرها…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۴۹
۳-۵-۶-انجام PCR…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..49
۳-۵-۶-۱-بهینه سازی اجزاء واکنش PCR………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..50
۳-۵-۶-۲-بهینه سازی تهیه Master Mix ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….50
۳-۵-۷-گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژن aer ………………………………………………………………………………………………50
(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت nefo.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))
۳-۵-۷-۱-گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژن HlyA…………………………………………………………………………………..51
۳-۵-۷-۲- گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژن Pap ……………………………………………………………………………………..51
۳-۵-۷-۳- گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژن Cnf ………………………………………………………………………………… 52
۳-۵-۷-۴- گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژن Afa ………………………………………………………………………………….. 53
۳-۵-۷-۵-گرادیانت دمایی جهت به دست آوردن دمای اتصال برای ژنFim ………………………………………………………………………………… 53
۳-۶-مراحل انجام PCR …………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………54
۳-۶-۱-بهینه سازی PCR ………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………54
۳-۶-۲-بررسی محصول PCR……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….55
۳-۷-مواد مورد نیاز برای انجام الکتروفورز………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۵۶
۳-۷-۱-ژل آگارز………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۵۶
عنوان صفحه
۳-۷-۱-۱-طرز تهییه ژل آگارز…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۵۶
۳-۷-۱-۳-بافر سنگین کننده…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۵۶
۳-۷-۱-۴-رنگ آمیزی ژل…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۵۷
۳-۸-توالی یابی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………۵۷
۳-۹-۱-روش گردآوری اطلاعات……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۵۷
۳-۹-۲-روش تجزیه و تحلیل اطلاعات…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۵۸
فصل چهارم: نتایج و بحث
۴-۱-فراوانی بیماران بر اساس جنس…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۵۹
۴-۲-نتایج مربوط به فراوانی فاکتورهای حدت در اشرشیا کلی…………………………………………………………………………………………………………………..۶۰
۴-۳-نتایج آزمون PCR برای شناسایی ژن آئروباکتین در سویه های واجد اشرشیا کلی یوروپاتوژن………………………………………………..۶۱
۴-۳-۱-بهینه سازی دمای اتصال………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۶۱
۴-۳-۱-۱-انجام آزمون روی سایر ایزوله ها…………………………………………………………………………………………………………………………………………………….۶۲
۴-۳-۲-نتایج آزمون PCR برای شناسایی ژن سایتوتوکسیک نکروز دهنده در سویه های واجد اشرشیا کلی یوروپاتوژن………..۶۴
۴-۳-۲-۱- بهینه سازی دمای اتصال…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۶۴
۴-۳-۲-۲- انجام آزمون روی سایر ایزوله ها…………………………………………………………………………………………………………………………………………………..۶۴
۴-۳-۳- نتایج آزمون PCR برای شناسایی ژن همولیزین در سویه های واجد اشرشیا کلی یوروپاتوژن…………………………………………..۶۵